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毒理學資料

一位毒理學家想知道,隨著劑量增加,接觸某種化學物是否會提高死亡率。她讓測試生物接觸不同劑量,並記錄每個水槽中死亡的數量。每個劑量在 3 個不同的日子各重複一次。

首先,建立一個 GLM。先從簡單模型開始有助於除錯。之後你也會把結果與 GLMER 比較。這個模型將 dosereplicate 視為固定效果(fixed effects)。

接著,建立一個 GLMER。這次把 dose 視為固定效果,而把 replicate 視為隨機截距(random-effects intercept)。

最後,使用各模型的 coef() 檢視係數估計。注意兩個模型的截距估計顯示方式不同。

本練習屬於課程

R 的階層式與混合效果模型

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# Fit glm_out and look at its coefficient estimates
glm_out <- glm(___ ~ ___ + ___,
               family = "___", data = df)
coef(___)
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