Lý thuyết DGE: Metadata
Dựa vào thông tin dưới đây, hãy tạo một data frame metadata cho dữ liệu đếm về xơ hóa có tên metadata với các cột genotype và condition. Tên mẫu (ví dụ: smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2, v.v.) phải là tên hàng của data frame:
Bài tập này là một phần của khóa học
RNA-Seq với Bioconductor trong R
Hướng dẫn bài tập
- Tạo một vector kiểu ký tự tên
genotypecho dữ liệu trên bằngc(). - Tạo một vector kiểu ký tự tên
conditioncho dữ liệu trên bằngc(). - Tạo một data frame tên
smoc2_metadatabằngdata.frame()từ hai vector ký tựgenotypevàcondition. - Tạo một vector tên mẫu bằng
c()và gán nó làm tên hàng của data frame bằngrownames().
Bài tập tương tác thực hành trực tiếp
Hãy thử làm bài tập này bằng cách hoàn thành đoạn mã mẫu này.
# Create genotype vector
genotype <- c(___)
# Create condition vector
condition <- c(___)
# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)
# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)