Tóm tắt kết quả DESeq2
LƯU Ý: Có thể mất thêm chút thời gian để tải bài tập này.
Bây giờ khi đã trích xuất được kết quả, bạn có thể xem nhanh số lượng gene biểu hiện khác biệt theo mức alpha đã chọn bằng hàm summary(). Hàm này sẽ trả về số lượng/tỷ lệ gene được điều hòa tăng và giảm, đồng thời cung cấp thông tin về lọc độc lập và các ngoại lệ (outliers) đã bị loại bỏ.
Bài tập này là một phần của khóa học
RNA-Seq với Bioconductor trong R
Hướng dẫn bài tập
- Kiểm tra có bao nhiêu gene biểu hiện khác biệt trong kết quả
smoc2_resbằng cách dùng hàmsummary()củaDESeq2.
Bài tập tương tác thực hành trực tiếp
Hãy thử làm bài tập này bằng cách hoàn thành đoạn mã mẫu này.
# Get an overview of the results
___