Luyện tập với vignette của DESeq2

Trong các video, bạn đang khảo sát sự khác biệt biểu hiện gene giữa mẫu bình thường và mẫu xơ hóa của chuột kiểu dại (wild-type). Trong các bài tập này, chúng ta sẽ khảo sát biểu hiện gene giữa mẫu bình thường và mẫu xơ hóa từ những con chuột biểu hiện quá mức gene smoc2.

Khi tự thực hiện phân tích biểu hiện khác biệt, vignette của DESeq2 là nơi đầu tiên bạn nên tìm câu trả lời cho mọi thắc mắc. Trong bài này, hãy khám phá vignette của DESeq2 và dùng nó để chọn đáp án phù hợp nhất cho câu hỏi sau:

Tại sao chúng ta dùng số đếm chưa chuẩn hóa làm đầu vào cho DESeq2?

LƯU Ý: Chưa chuẩn hóa nghĩa là số đếm chưa được điều chỉnh theo kích thước thư viện, tức tổng số lượt đọc (reads) được đếm trên mỗi mẫu.