DGE Teorisi: Üstveri (Metadata)
Aşağıdaki bilgileri kullanarak, fibrozis sayım verileri için genotype ve condition sütunlarına sahip, metadata adlı bir üstveri (metadata) veri çerçevesi oluştur. Örnek adları (ör. smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2, vb.) veri çerçevesinin satır adları olmalıdır:
Bu egzersiz, kursun bir parçasıdır
R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq
Egzersiz talimatları
- Yukarıdaki veriler için
c()kullanarakgenotypeadlı bir karakter vektörü oluştur. - Yukarıdaki veriler için
c()kullanarakconditionadlı bir karakter vektörü oluştur. data.frame()vegenotypeileconditionkarakter vektörlerini kullanaraksmoc2_metadataadlı bir veri çerçevesi oluştur.c()kullanarak bir örnek adları vektörü oluştur ve bunurownames()ile veri çerçevesinin satır adlarına ata.
Uygulamalı etkileşimli egzersiz
Bu egzersizi bu örnek kodu tamamlayarak deneyin.
# Create genotype vector
genotype <- c(___)
# Create condition vector
condition <- c(___)
# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)
# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)