DESeq2 vinyeti ile alıştırma

Videolarda, yabanıl tip (wild-type) farelerde normal ve fibrozis örnekleri arasındaki gen ifadesi farklarını inceliyoruz. Bu alıştırmalarda ise smoc2 genini aşırı ifade eden farelerden alınan normal ve fibrozis örnekleri arasındaki gen ifadesini keşfedeceğiz.

Kendi başına diferansiyel ifade analizleri yaparken, DESeq2 vinyeti aklına takılan sorular için bakacağın ilk yer olmalı. Bu alıştırmada DESeq2 vinyetini incele ve aşağıdaki soruya en iyi yanıtı seçmek için kullan:

DESeq2 için neden girdi olarak normalleştirilmemiş sayımları kullanıyoruz?

NOT: Normalleştirilmemiş, sayımların kütüphane boyutuna göre ayarlanmadığı anlamına gelir; kütüphane boyutu, örnek başına sayılan toplam okuma sayısıdır.