DESeq2 anlamlı sonuçlar
NOT: Bu egzersizin yüklenmesi biraz daha uzun sürebilir.
Şimdi anlamlı sonuçları çıkaralım! Önceki egzersizden elde ettiğimiz smoc2_res sonuçlarının hazır olduğunu varsay.
Bu egzersiz, kursun bir parçasıdır
R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq
Egzersiz talimatları
Sonuç nesnesi üzerinde
data.frame()fonksiyonunu kullanaraksmoc2_ressonuçlarını bir data frame olarak kaydet.subset()fonksiyonunu kullanarak ayarlanmış p-değeri 0.05'ten küçük (alfa değeri) olan anlamlı genleri çıkar.
Uygulamalı etkileşimli egzersiz
Bu egzersizi bu örnek kodu tamamlayarak deneyin.
# Save results as a data frame
smoc2_res_all <- ___(___)
# Subset the results to only return the significant genes with p-adjusted values less than 0.05
smoc2_res_sig <- ___(___, ___ < ___)