Toxikologidata
En toxikolog undrar om exponering för en kemikalie ökar dödligheten när dosen ökar. Hon har exponerat testorganismer för olika doser av en kemikalie och registrerat antalet som dog i varje testtank. Varje dos upprepades under tre olika dagar.
Bygg först en GLM. En enkel modell gör felsökning lättare. Du kommer också att jämföra resultaten med GLMER senare. Den här modellen inkluderar dose och replicate som fasta effekter.
Bygg sedan en GLMER. Den här gången är dose en fast effekt och replicate är ett intercept för slumpmässiga effekter.
Undersök slutligen koefficientskattningarna med coef() från varje modell. Lägg märke till hur interceptskattningarna visas olika beroende på modell.
Den här övningen är en del av kursen
Hierarkiska modeller och modeller med blandade effekter i R
Interaktiv övning med praktiskt arbete
Testa den här övningen genom att slutföra den här exempelkoden.
# Fit glm_out and look at its coefficient estimates
glm_out <- glm(___ ~ ___ + ___,
family = "___", data = df)
coef(___)