Logistisk regression
I toxikologiska studier utsätts organismer ofta för olika doser, och resultatet är vanligtvis binärt – till exempel död/levande eller hämmad/rörlig. Detta kallas en dos-responsstudie. Svaret på olika doser kan exempelvis vara dödlighet (1) eller överlevnad (0) vid studiens slut.
I den här övningen anpassar du en logistisk regression med hjälp av alla tre metoder som beskrivs i videon. Du har tillgång till två datamängder.
df_long, i ett "långt" format där varje rad motsvarar en observation (dvs. ett 0 eller 1).df_short, i ett aggregerat format där varje rad motsvarar en behandling (t.ex. 6 lyckade, 4 misslyckade, antal replikat = 10, andel = 0,6).
När du använder den "breda" eller "korta" dataramen kräver metoderna "success, failure" för att mata in logistiska regressionsresultat att success och failure är en matris. Det enklaste sättet är att använda funktionen cbind().
Tips: När du arbetar med verkliga data bör du alltid kontrollera vad 0 och 1 motsvarar. Olika personer använder olika notation, och felaktiga antaganden kan ställa till problem!
Den här övningen är en del av kursen
Hierarkiska modeller och modeller med blandade effekter i R
Interaktiv övning med praktiskt arbete
Testa den här övningen genom att slutföra den här exempelkoden.
# Fit a glm using data in a long format
fit_long <- glm(___ ~ ___, data = df_long,
family = "___")
summary(___)