НачатьНачать бесплатно

Работа с виньеткой DESeq2

В видеоуроках мы изучаем различия в экспрессии генов между нормальными образцами и образцами с фиброзом у мышей дикого типа. В упражнениях мы будем исследовать экспрессию генов между нормальными образцами и образцами с фиброзом у мышей со сверхэкспрессией гена smoc2.

Когда вы будете самостоятельно проводить анализ дифференциальной экспрессии, виньетка DESeq2 станет первым источником ответов на любые вопросы. В этом упражнении изучите виньетку DESeq2 и выберите наиболее точный ответ на вопрос:

Почему в качестве входных данных для DESeq2 используются ненормализованные счётчики?

ПРИМЕЧАНИЕ: Ненормализованные означает, что счётчики не скорректированы с учётом размера библиотеки — то есть суммарного числа ридов, подсчитанных для каждого образца.

Это упражнение является частью курса

RNA-Seq с Bioconductor в R

Посмотреть курс

Практическое интерактивное упражнение

Превратите теорию в практику с помощью одного из наших интерактивных упражнений

Начать упражнение