Обзор результатов DESeq2
ПРИМЕЧАНИЕ: Загрузка этого упражнения может занять немного больше времени.
Теперь, когда результаты получены, можно сформировать удобный обзор: сколько генов дифференциально экспрессировано при заданном уровне alpha. Для этого используйте функцию summary(). Она выведет количество и долю генов с повышенной и пониженной экспрессией, а также информацию о независимой фильтрации и удалённых выбросах.
Это упражнение является частью курса
RNA-Seq с Bioconductor в R
Инструкции к упражнению
- Проверьте, сколько генов дифференциально экспрессировано в результатах
smoc2_res, используя функциюsummary()из пакетаDESeq2.
Интерактивное практическое упражнение
Попробуйте выполнить это упражнение, дополнив этот пример кода.
# Get an overview of the results
___