Значимые результаты DESeq2

ПРИМЕЧАНИЕ: Загрузка этого упражнения может занять немного больше времени.

Теперь извлечём значимые результаты! Предположим, что результаты из предыдущего упражнения уже получены и сохранены в объекте smoc2_res.

Это упражнение является частью курса

RNA-Seq с Bioconductor в R

Посмотреть курс

Инструкции к упражнению

Сохраните результаты smoc2_res в виде фрейма данных с помощью функции data.frame(), применив её к объекту результатов.
Извлеките значимые гены со скорректированными p-значениями меньше 0,05 (значение alpha) с помощью функции subset().

Интерактивное практическое упражнение

Попробуйте выполнить это упражнение, дополнив этот пример кода.

# Save results as a data frame
smoc2_res_all <- ___(___)

# Subset the results to only return the significant genes with p-adjusted values less than 0.05
smoc2_res_sig <- ___(___, ___ < ___)

Редактировать и запускать код