Praticando com a vinheta do DESeq2
Nos vídeos, estamos explorando diferenças de expressão gênica entre amostras normais e com fibrose de camundongos do tipo selvagem. Nestes exercícios, vamos explorar a expressão gênica entre amostras normais e com fibrose de camundongos que superexpressam o gene smoc2.
Ao realizar análises de expressão diferencial por conta própria, a vinheta do DESeq2 será o primeiro lugar para buscar respostas para qualquer dúvida. Neste exercício, explore a vinheta do DESeq2 e use-a para escolher a melhor resposta abaixo para a pergunta:
Por que usamos contagens não normalizadas como entrada para o DESeq2?
OBSERVAÇÃO: Não normalizadas significa que as contagens não foram ajustadas pelo tamanho da biblioteca, que é o número total de leituras contadas por amostra.
Este exercício faz parte do curso
RNA-Seq com Bioconductor em R
Exercício interativo prático
Transforme a teoria em ação com um de nossos exercícios interativos
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