ComeçarComece de graça

Praticando com a vinheta do DESeq2

Nos vídeos, estamos explorando diferenças de expressão gênica entre amostras normais e com fibrose de camundongos do tipo selvagem. Nestes exercícios, vamos explorar a expressão gênica entre amostras normais e com fibrose de camundongos que superexpressam o gene smoc2.

Ao realizar análises de expressão diferencial por conta própria, a vinheta do DESeq2 será o primeiro lugar para buscar respostas para qualquer dúvida. Neste exercício, explore a vinheta do DESeq2 e use-a para escolher a melhor resposta abaixo para a pergunta:

Por que usamos contagens não normalizadas como entrada para o DESeq2?

OBSERVAÇÃO: Não normalizadas significa que as contagens não foram ajustadas pelo tamanho da biblioteca, que é o número total de leituras contadas por amostra.

Este exercício faz parte do curso

RNA-Seq com Bioconductor em R

Ver curso

Exercício interativo prático

Transforme a teoria em ação com um de nossos exercícios interativos

Começar o exercício