Resultados do DESeq2 - redução de LFC

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Para melhorar as estimativas de fold change dos nossos dados, queremos pegar os resultados e reduzir os log2 fold changes usando a função lfcShrink().

Considere que todas as etapas anteriores já foram executadas, incluindo a criação do objeto do DESeq2, dds_smoc2, a execução da função DESeq() e a extração dos resultados, smoc2_res.

Este exercício faz parte do curso

RNA-Seq com Bioconductor em R

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Instruções do exercício

Realize a redução dos log2 fold changes usando a função lfcShrink().

Exercício interativo prático

Experimente este exercício completando este código de exemplo.

# Shrink the log2 fold change estimates to be more accurate
smoc2_res <- lfcShrink(___, 
                    contrast =  c(___, ___, ___),
                    res = ___)

Editar e executar o código