Modelo DESeq2 - extraindo resultados

OBSERVAÇÃO: Carregar este exercício pode levar um pouco mais de tempo.

Depois de explorar as dispersões e concluir que os dados se ajustam bem ao modelo DESeq2, queremos extrair os resultados.

Considere que todas as etapas anteriores foram executadas, incluindo a criação do objeto DESeq2, dds_smoc2, e a execução da função DESeq().

Este exercício faz parte do curso

RNA-Seq com Bioconductor em R

Use a função results() para especificar o contraste da comparação usando um alfa de 0.05. Para a condição de interesse, condition, gere os resultados para o grupo de amostras fibrosis em relação ao grupo de amostras normal, de modo que o grupo normal seja o nível base.

Experimente este exercício completando este código de exemplo.

# Extract the results of the differential expression analysis
smoc2_res <- results(___, 
                ___ = ___, 
                alpha = ___)