Translacje
W tym rozdziale wykorzystamy dane z projektu Open Access Series of Imaging Studies, aby porównać mózgi różnych grup: młodych i starszych, kobiet i mężczyzn, zdrowych i chorych.
Na początek wyśrodkuj jeden przekrój trójwymiarowego wolumenu mózgu (im). Znajdź punkt środkowy tablicy obrazu oraz środek masy mózgu, a następnie przesuń obraz do środka.
We wszystkich ćwiczeniach tego rozdziału zastosowano następujące importy:
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
To ćwiczenie jest częścią kursu
Analiza obrazów biomedycznych w Pythonie
Interaktywne ćwiczenie praktyczne
Spróbuj tego ćwiczenia, uzupełniając ten przykładowy kod.
# Find image center of mass
com = ____
# Calculate amount of shift needed
d0 = 128 - _____
d1 = ____
# Translate the brain towards the center
xfm = ndi.shift(____, shift=____)