Het aantal PC's kiezen
Een van de grootste uitdagingen bij PCA is het kiezen van het aantal PC’s. Dat kun je doen door te kijken naar de cumulatieve proportie verklaarde variantie. We gebruiken deze methode om het aantal PC’s te kiezen dat nodig is om 95% van de variantie in de state.x77-gegevens te verklaren. De proportie verklaarde variantie per PC is voor je ingeladen als het object pca.pvar.
Deze oefening maakt deel uit van de cursus
Multivariate kansverdelingen in R
Praktische interactieve oefening
Probeer deze oefening eens door deze voorbeeldcode in te vullen.
# Proportion of variance explained by each principal component
# Cumulative variance explained plot
plot(___, xlab = "Principal component", ylab = "Cumulative Proportion of variance explained", ylim = c(0,1), type = 'b')
grid()