Volumes laden
De functie volread() van ImageIO kan multidimensionale gegevenssets laden en 3D-volumes maken uit een map met afbeeldingen. Het kan ook metadata over deze meerdere afbeeldingen heen samenvoegen.
Lees in deze oefening een compleet volume met hersengegevens in uit de map "tcia-chest-ct", die 25 DICOM-afbeeldingen bevat.
Deze oefening maakt deel uit van de cursus
Biomedische beeldanalyse met Python
Oefeninstructies
- Gebruik
volread()om de map "tcia-chest-ct" te laden. - Print de beschikbare metadata met de methode
keys()vanvol.meta. - Print de
shapevan het volume.
Interactieve oefening met praktijkervaring
Probeer deze oefening door deze voorbeeldcode aan te vullen.
# Import ImageIO
import imageio.v2 as ____
# Load the "tcia-chest-ct" directory
vol = ____
# Print image attributes
print('Available metadata:', ____)
print('Shape of image array:', ____)