Aan de slagBegin gratis

Afbeeldingen plotten

Misschien wel het belangrijkste principe van beeldanalyse is: bekijk je afbeeldingen!

Met Matplotlibs functie imshow() kan dat heel eenvoudig. Met een paar handige argumenten kom je al ver:

  • cmap bepaalt de kleurtoewijzing per waarde. De colormap "gray" is gebruikelijk, maar er zijn veel andere beschikbaar.
  • vmin en vmax regelen het kleurcontrast tussen waarden. Door deze aan te passen, verklein je de invloed van extreme waarden.
  • plt.axis('off') verwijdert de assen en ticklabels uit de afbeelding.

Plot in deze oefening de CT-scan en onderzoek het effect van een paar verschillende parameters.

Deze oefening maakt deel uit van de cursus

Biomedische beeldanalyse met Python

Bekijk cursus

Interactieve oefening met praktijkervaring

Probeer deze oefening door deze voorbeeldcode aan te vullen.

# Import ImageIO and PyPlot 
import imageio.v2 as imageio
import ____ as plt

# Read in "chest-220.dcm"
im = ____
Code bewerken en uitvoeren