Traslazioni
In questo capitolo useremo i dati della Open Access Series of Imaging Studies per confrontare i cervelli di diverse popolazioni: giovani e anziani, maschi e femmine, sani e con patologie.
Per iniziare, centra una singola slice di un volume cerebrale 3D (im). Per prima cosa trova il punto centrale nell'array dell'immagine e il baricentro del cervello. Poi, trasla l'immagine verso il centro.
Gli esercizi di questo capitolo usano tutti i seguenti import:
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
Questo esercizio fa parte del corso
Analisi di immagini biomediche in Python
esercizio interattivo pratico
Prova questo esercizio completando questo codice di esempio.
# Find image center of mass
com = ____
# Calculate amount of shift needed
d0 = 128 - _____
d1 = ____
# Translate the brain towards the center
xfm = ndi.shift(____, shift=____)