Impila le immagini
Gli "stack" di immagini sono una metafora utile per capire i dati multidimensionali. Ogni dimensione più alta è uno stack di array di dimensione inferiore.
In questo esercizio useremo la funzione stack() di NumPy per combinare più array 2D in un volume 3D. Per convenzione, i dati volumetrici vanno impilati lungo la prima dimensione: vol[plane, row, col].
Nota: eseguire qualsiasi operazione su un oggetto Image di ImageIO lo converte in un numpy.ndarray, rimuovendone i metadati.
Questo esercizio fa parte del corso
Analisi di immagini biomediche in Python
Istruzioni dell'esercizio
- Importa
imageioenumpy(comenp). - Carica "chest-220.dcm", "chest-221.dcm" e "chest-222.dcm".
- Crea un volume 3D usando
np.stack(). Impostaaxisdi stacking a 0. - Stampa l'attributo
shapedivol.
esercizio interattivo pratico
Prova questo esercizio completando questo codice di esempio.
# Import ImageIO and NumPy
import imageio.v2 as imageio
import ____ as ____
# Read in each 2D image
im1 = imageio.imread('chest-220.dcm')
im2 = ____
im3 = ____
# Stack images into a volume
vol = np.stack(____)
print('Volume dimensions:', ____)