Visualiser un modèle de Weibull
Dans cet exercice, nous allons reproduire l'exemple de la vidéo en suivant les étapes suivantes :
- Estimer un modèle de Weibull
- Définir des « patients imaginaires »
- Calculer les courbes de survie
- Créer un
data.frameavec l'information des courbes de survie - Tracer le graphique
Nous allons maintenant nous concentrer sur les deux dernières étapes.
Les packages survival, survminer et reshape2, ainsi que les données GBSG2, sont déjà chargés pour vous dans cet exercice.
Le modèle de Weibull wbmod et les données des patients imaginaires newdat que vous avez déjà calculés sont aussi disponibles.
Cette activité fait partie du cours
Analyse de survie avec R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Use cbind() to combine the information in newdat with t
surv_wbmod_wide <- cbind(newdat, t)
# Use melt() to bring the data.frame to long format
surv_wbmod <- melt(surv_wbmod_wide, id.vars = c("___", "___"), variable.name = "surv_id", value.name = "___")