Projet de synthèse : le modèle de Cox
Pour conclure le cours, revenons au jeu de données sur le cancer du poumon que nous avons utilisé brièvement dans les 2 derniers chapitres. En résumé, ce jeu de données contient des informations sur la survie de patients atteints d'un cancer du poumon avancé provenant du North Central Cancer Treatment Group. L'événement est stocké dans la variable status, qui prend la valeur 2 si une personne n'a pas survécu. Le score de performance (variable performance) mesure à quel point un patient peut effectuer ses activités quotidiennes habituelles (mauvais=0, bon=100), tel qu'évalué par un médecin. Nous voulons connaître l'association entre certains scores de performance et le temps de survie.
Cette activité fait partie du cours
Analyse de survie avec R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Compute Cox model and survival curves
cxmod <- ___(___(___, ___) ~ ___, data = lung)
new_lung <- data.frame(performance = ___)
cxsf <- ___(cxmod, data = ___, newdata = ___, conf.type = "none")