Visualiser un modèle de Cox

Dans cet exercice, nous allons reproduire l'exemple de la vidéo en suivant les étapes suivantes :

Calculer le modèle de Cox
Définir des « patients imaginaires »
Calculer les courbes de survie
Créer un data.frame avec l'information sur les courbes de survie
Tracer le graphique

Nous allons maintenant nous concentrer sur les deux dernières étapes dans cet exercice.

Les packages survival et survminer ainsi que les données GBSG2 sont déjà chargés pour vous dans cet exercice. Le modèle de Cox cxmod, les données des patients imaginaires newdat et l'information sur les courbes de survie cxsf de l'exercice précédent sont aussi disponibles.

Cette activité fait partie du cours

Analyse de survie avec R

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Exercice interactif pratique

Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.

# Compute data.frame needed for plotting
surv_cxmod0 <- ___(cxsf)

# Look at the first few lines
___(surv_cxmod0)

Modifier et exécuter le code