Estimer la survie médiane à partir d'un modèle de Weibull
Nous pouvons maintenant estimer la survie des patientes atteintes d'un cancer du sein dans les données GBSG2 à l'aide d'un modèle de Weibull (fonction survreg()).
Rappelez-vous : le modèle de Weibull estime une fonction de survie lisse, plutôt qu'une fonction en escalier, comme celle estimée par la méthode de Kaplan-Meier.
La fonction predict() avec type = "quantile" permet de calculer les quantiles de la fonction de distribution.
Nous allons l'utiliser pour calculer la survie médiane.
Le paquet survival et les données GBSG2 sont déjà chargés pour vous dans cet exercice.
Cette activité fait partie du cours
Analyse de survie avec R
Instructions de l’exercice
- Estimez un modèle de Weibull pour les patientes atteintes d'un cancer du sein.
- Calculez la survie médiane à partir de ce modèle à l'aide de la fonction
predict()avectype = "quantile".
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Weibull model
wb <- ___(Surv(time, cens) ~ 1, data = GBSG2)
# Compute the median survival from the model
predict(wb, type = "quantile", p = ___, newdata = data.frame(1))