Quantiles de courbe de survie à partir d'un modèle de Weibull
Nous pouvons maintenant estimer la survie des patientes atteintes d'un cancer du sein dans les données GBSG2 à l'aide d'un modèle de Weibull.
La fonction predict() avec type = "quantile" permet de calculer les quantiles de la fonction de répartition. Comme nous l'avons vu jusqu'ici dans ce cours, la fonction de survie correspond à 1 moins la fonction de répartition
(\(S = 1 - D\)). Nous pouvons donc calculer facilement les quantiles de la fonction de survie avec la fonction predict().
Le paquet survival et les données GBSG2 sont déjà chargés pour vous dans cet exercice.
Cette activité fait partie du cours
Analyse de survie avec R
Instructions de l’exercice
- Estimez un modèle de Weibull pour les patientes atteintes d'un cancer du sein.
- Obtenez le moment où la probabilité de survivre au-delà de ce temps est de 70 % (en utilisant la fonction
predict()avectype = "quantile").
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Weibull model
wb <- ___(Surv(___, ___) ~ 1, data = GBSG2)
# 70 Percent of patients survive beyond time point...
predict(wb, type = ___, p = ___, newdata = data.frame(1))