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Sélectionner des objets

Les étiquettes agissent comme des « poignées » d'objets : elles vous permettent de récupérer des ensembles entiers de pixels en une seule fois. Pour sélectionner un objet précis :

  1. Trouvez la valeur d'étiquette associée à l'objet.
  2. Créez un masque des pixels correspondants.

Dans cet exercice, créez un tableau étiqueté à partir du mask fourni. Ensuite, trouvez la valeur d'étiquette du ventricule gauche situé au centre et créez un masque pour celui-ci.

Cette activité fait partie du cours

Analyse d'images biomédicales en Python

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Instructions de l’exercice

  • Utilisez ndi.label() pour attribuer des étiquettes à chaque objet distinct dans mask.
  • Trouvez la valeur d'index de l'étiquette du ventricule gauche en vérifiant le pixel central (128, 128).
  • Créez un masque des pixels correspondant à l'étiquette du ventricule gauche. Avec np.where, mettez les pixels étiquetés lv_val à 1 et les autres à np.nan.
  • Utilisez plt.imshow() pour superposer l'étiquette sélectionnée sur le graphique actuel.

Exercice interactif pratique

Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.

# Label the image "mask"
labels, nlabels = ____

# Select left ventricle pixels
lv_val = ____[128, 128]
lv_mask = ____

# Overlay selected label
plt.imshow(____, cmap='rainbow')
plt.show()
Modifier et exécuter le code