Translations
Dans ce chapitre, nous allons exploiter les données de la Open Access Series of Imaging Studies pour comparer le cerveau de différentes populations : jeunes et aînés, hommes et femmes, personnes en santé et personnes atteintes d'une maladie.
Pour commencer, centrez une tranche unique d'un volume cérébral 3D (im). D'abord, trouvez le point central dans le tableau d'images et le centre de masse du cerveau. Ensuite, translatez l'image vers le centre.
Tous les exercices de ce chapitre ont déjà importé ce qui suit :
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
Cette activité fait partie du cours
Analyse d'images biomédicales en Python
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Find image center of mass
com = ____
# Calculate amount of shift needed
d0 = 128 - _____
d1 = ____
# Translate the brain towards the center
xfm = ndi.shift(____, shift=____)