Schätzung und Visualisierung einer Überlebenskurve
Schauen wir uns das Überleben von Brustkrebspatientinnen an.
In dieser Übung arbeiten wir wieder mit dem Datensatz GBSG2.
Die Pakete survival und survminer sowie die Daten GBSG2 sind für dich bereits geladen.
Diese Übung ist Teil des Kurses
Survival-Analyse in R
Anleitung zur Übung
- Schätze eine Überlebensfunktion für die Brustkrebspatientinnen.
- Visualisiere die geschätzte Überlebensfunktion mit der Funktion
ggsurvplot(). - Füge dem Plot eine Risikotabelle hinzu, die die Anzahl der Patientinnen unter Beobachtung zeigt. Das geht über das Argument
risk.table. - Füge eine Linie für die mediane Überlebenszeit hinzu. Das geht über das Argument
surv.median.line.
Interaktive Übung
Vervollständige den Beispielcode, um diese Übung erfolgreich abzuschließen.
# Kaplan-Meier estimate
km <- survfit(Surv(___, ___) ~ ___, data = ___)
# Plot of the Kaplan-Meier estimate
ggsurvplot(___)
# Add the risk table to plot
ggsurvplot(___, ___ = TRUE)
# Add a line showing the median survival time
ggsurvplot(___, ___ = TRUE, ___ = "hv")