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Toxikologie-Daten

Eine Toxikologin möchte wissen, ob die Exposition gegenüber einer Chemikalie die Sterblichkeit mit steigender Dosis erhöht. Sie hat Testorganismen verschiedenen Dosen ausgesetzt und die Anzahl der Tiere erfasst, die in jedem Testbecken gestorben sind. Jede Dosis wurde an drei verschiedenen Tagen wiederholt.

Baue zuerst ein GLM. Ein einfaches Modell erleichtert das Debuggen. Außerdem vergleichst du später die Ergebnisse mit GLMER. Dieses Modell enthält dose und replicate als Fixed Effects.

Erstelle als Nächstes ein GLMER. Diesmal ist dose ein Fixed Effect und replicate ein Random-Effects-Intercept.

Untersuche zuletzt die Koeffizientenschätzungen mit coef() aus jedem Modell. Achte darauf, dass die Intercept-Schätzungen in den Modellen unterschiedlich dargestellt werden.

Diese Übung ist Teil des Kurses

Hierarchische und gemischte Effekte-Modelle in R

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Interaktive Übung

Vervollständige den Beispielcode, um diese Übung erfolgreich abzuschließen.

# Fit glm_out and look at its coefficient estimates
glm_out <- glm(___ ~ ___ + ___,
               family = "___", data = df)
coef(___)
Code bearbeiten und ausführen