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DGE 理论:元数据

请根据下方信息为纤维化计数数据创建一个名为 metadata 的元数据数据框,包含 genotypecondition 两列。示例名称(如 smoc2_fibrosis1smoc2_fibrosis2 等)应作为数据框的行名:

smoc2 metadata

本练习是课程的一部分

使用 R 中的 Bioconductor 进行 RNA-Seq 分析

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练习说明

  • 使用 c() 为上述数据创建一个名为 genotype 的字符向量。
  • 使用 c() 为上述数据创建一个名为 condition 的字符向量。
  • 使用 data.frame()genotypecondition 字符向量创建一个名为 smoc2_metadata 的数据框。
  • 使用 c() 创建一个样本名称向量,并使用 rownames() 将其指定为数据框的行名。

交互式实操练习

通过完成这段示例代码来试试这个练习。

# Create genotype vector
genotype <- c(___)

# Create condition vector
condition <- c(___)

# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)

# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)
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