DESeq2 显著性结果
注意: 加载此练习可能需要稍长时间。
现在来提取显著性结果!假设我们已经从上一个练习中得到了结果对象 smoc2_res。
本练习是课程的一部分
使用 R 中的 Bioconductor 进行 RNA-Seq 分析
练习说明
使用
data.frame()函数将结果对象smoc2_res保存为数据框。使用
subset()函数提取校正后 p 值小于 0.05(alpha 值)的显著基因。
交互式实操练习
通过完成这段示例代码来试试这个练习。
# Save results as a data frame
smoc2_res_all <- ___(___)
# Subset the results to only return the significant genes with p-adjusted values less than 0.05
smoc2_res_sig <- ___(___, ___ < ___)