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练习:阅读 DESeq2 小册

在视频中,我们比较了野生型小鼠正常样本与纤维化样本之间的基因表达差异。在本练习中,您将比较过表达 smoc2 基因的小鼠的正常样本与纤维化样本的基因表达。

当您自行进行差异表达分析时,DESeq2 小册通常是解答问题的首选参考。在本练习中,请查阅 DESeq2 小册,并据此为下面的问题选择最佳答案:

"为什么在 DESeq2 中要使用未归一化(unnormalized)的计数作为输入?"

注意:未归一化是指计数尚未根据文库大小进行调整;文库大小是指每个样本中被计数的总 reads 数。

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使用 R 中的 Bioconductor 进行 RNA-Seq 分析

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