RNA-Seq 差异表达分析——实验规划

成功开展 RNA-Seq 差异表达分析的关键是良好的实验规划。为避免批次效应，并在样本组之间合理分离已知的变异来源，我们将为计划中的 RNA-Seq 实验选择最佳的样本分批方式。

我们的元数据包含关于样本的信息，包括：

• sample： 样本名称
• treatment： A 或 B
• sex： M 或 F
• replicate： 1、2、3、4

由于组织提取流程耗时，您每次只能同时从 4 个样本中分离 RNA，而且每个分组有 4 个生物学重复。以下哪一种是进行 RNA Isolation（RNA 分离）以避免批次效应的最佳分批方式：

• Option A：

• Option B：

• Option C：

• Option D：