Lojistik regresyon
Toksikoloji çalışmalarında organizmalara sıklıkla doz verilir ve ölü/sağ veya inhibe/hareketli gibi ikili sonuçlar gözlenir. Buna doz-yanıt çalışması denir. Örneğin, farklı dozlara verilen yanıt bir çalışmanın sonunda ölüm (1) ya da hayatta kalma (0) olabilir.
Bu egzersizde, videoda anlatılan üç yöntemin tamamını kullanarak bir lojistik regresyon kuracağız. Sana iki veri kümesi verildi.
- "Uzun" formatta olan
df_long, her satırı bir gözleme (yani 0 veya 1) karşılık gelir. - Özetlenmiş formatta olan
df_short, her satırı bir işleme karşılık gelir (ör. 6 başarı, 4 başarısızlık, tekrar sayısı = 10, oran = 0.6).
"Geniş" veya "kısa" veri çerçevesini kullanırken, lojistik regresyon sonuçlarını girdi olarak alan "başarı, başarısızlık" yöntemlerinde başarı ve başarısızlığın bir matris olması gerekir. Bunu yapmanın en kolay yolu cbind() fonksiyonunu kullanmaktır.
İpucu: Gerçek dünyadaki verilerle çalışırken, 0 ve 1in neye karşılık geldiğini mutlaka kontrol et. Farklı kişiler farklı gösterimler kullanır ve yanlış varsayımlar yaparsan başın ağrıyabilir!
Bu egzersiz, kursun bir parçasıdır
R'da Hiyerarşik ve Karma Etkili Modeller
Uygulamalı etkileşimli egzersiz
Bu egzersizi bu örnek kodu tamamlayarak deneyin.
# Fit a glm using data in a long format
fit_long <- glm(___ ~ ___, data = df_long,
family = "___")
summary(___)