Kalbi segment et
Bu bölümde, manyetik rezonans (MR) görüntüleme verileriyle, Sunnybrook Cardiac Dataset üzerinden çalışacağız. Tüm görüntü, tek bir kalp atımını kapsayan 3B bir zaman serisidir. Bu veriler, radyologlar tarafından her atımda sol karıncıktan atılan kanın oranı olan ejeksiyon fraksiyonunu ölçmek için kullanılır.
Başlamak için, hacmin tek bir diliminden (im) sol karıncığı segmente et. Önce görüntüyü filtreleyip maskelersin; ardından her bir nesneyi ndi.label() ile etiketlersin.
Bu bölümün egzersizlerinde şu içe aktarmalar var:
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
Bu egzersiz, kursun bir parçasıdır
Python ile Biyomedikal Görüntü Analizi
Uygulamalı etkileşimli egzersiz
Bu egzersizi bu örnek kodu tamamlayarak deneyin.
# Smooth intensity values
im_filt = ____
# Select high-intensity pixels
mask_start = np.where(____, 1, 0)
mask = ____
# Label the objects in "mask"
labels, nlabels = ____
print('Num. Labels:', ____)