Ötelemeler
Bu bölümde, farklı popülasyonların beyinlerini karşılaştırmak için Open Access Series of Imaging Studies verilerini kullanacağız: genç ve yaşlı, erkek ve kadın, sağlıklı ve hastalıklı.
Başlamak için, 3B bir beyin hacmindeki (im) tek bir dilimi merkeze al. Önce görüntü dizisindeki orta noktayı ve beynin kütle merkezini bul. Sonra, görüntüyü merkeze taşımak için ötele.
Bu bölümdeki egzersizlerde şu içe aktarmalar kullanılıyor:
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
Bu egzersiz, kursun bir parçasıdır
Python ile Biyomedikal Görüntü Analizi
Uygulamalı etkileşimli egzersiz
Bu egzersizi bu örnek kodu tamamlayarak deneyin.
# Find image center of mass
com = ____
# Calculate amount of shift needed
d0 = 128 - _____
d1 = ____
# Translate the brain towards the center
xfm = ndi.shift(____, shift=____)