Weibull と対数正規モデルの比較 I
この演習では、生存確率を正しくデータフレームに追加します。作成したデータフレームは生存曲線のプロットに使います。surv_wide は、ホルモン療法に関する情報と、Weibull モデルおよび対数正規モデルの生存曲線を含むワイド形式のデータフレームです。
この演習では、survival、survminer、reshape2 パッケージと GBSG2 データが読み込まれています。
この演習はコースの一部です
Rで学ぶサバイバル分析
演習の手順
- データフレームをロング形式に変換します。
surv_long$surv_idを使って、生存確率survをデータフレームに正しく追加します。
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Melt the data.frame into long format.
surv_long <- melt(surv_wide, ___ = c("horTh", "dist"), ___ = "surv_id", ___ = "time")
# Add column for the survival probabilities
surv_long$surv <- surv[as.numeric(surv_long$___)]
# Add columns upper, lower, std.err, and strata contianing NA values
surv_long[, c("upper", "lower", "std.err", "strata")] <- NA