Coxモデルから生存曲線を計算する
この演習では、動画の例を次の手順で再現します。
- Coxモデルを計算する
- 「仮想患者」を決める
- 生存曲線を計算する
- 生存曲線情報を含む
data.frameを作成する - プロットする
この演習では最初の3つの手順に取り組み、残りの2つは次の演習で行います。
この演習では、survival と survminer パッケージ、および GBSG2 データが読み込まれています。
この演習はコースの一部です
Rで学ぶサバイバル分析
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Cox model
cxmod <- ___(Surv(time, cens) ~ horTh + tsize, data = GBSG2)
# Imaginary patients
newdat <- expand.grid(
horTh = levels(GBSG2$___),
tsize = quantile(GBSG2$___, probs = c(0.25, 0.5, 0.75)))
___(newdat) <- letters[1:6]
# Inspect newdat
newdat