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演習

デンドログラムから切り取った枝の探索

cutree() 関数は、演習 5 と 6 で使用しましたが、h パラメーターを指定することで、特定の高さでツリーを切ることもできます。前の演習で生成したクラスターを、高さ 20 と 40 のそれぞれについて確認してみましょう。

指示

100 XP
  • cutree() に h = 20 を指定して、クラスター割り当てベクトル clusters_h20 を作成してください。
  • クラスターの割り当てを cluster 列として lineup データフレームに追加し、結果を lineup_h20_complete という新しいデータフレームに保存してください。
  • 上記の 2 つのステップを高さ 40 に対して繰り返し、変数 clusters_h40 と lineup_h40_complete を生成してください。
  • ggplot2 を使って、両方の高さについてクラスターの割り当てで色分けした散布図を作成してください。