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演習

高さに基づくクラスター

これまでの演習では、クラスター数(k)をあらかじめ指定して観測値をグループ化してきました。この演習では、デンドログラムの視覚的な表現を活用し、最大高さ(h)を基準にクラスターを形成します。指定した高さより下でクラスターがまとまる仕組みです。

dendextend ライブラリの color_branches() 関数を使い、デンドログラム上の任意の高さで形成されるクラスターを色分けして確認しましょう。

hc_players は、前の演習で使用したサッカーのラインアップデータから引き継がれています。

指示

100 XP
  • as.dendrogram() 関数を使って、hclust の結果から dendrogram オブジェクト dend_players を作成してください。
  • デンドログラムを描画してください。
  • color_branches() 関数を使い、カット高さ 20 でクラスターを色分けした新しいデンドログラムを作成・描画してください。
  • 同じ手順を高さ 40 で繰り返してください。