Teori DGE: Metadata
Gunakan informasi di bawah ini untuk membuat data frame metadata untuk data hitungan fibrosis bernama metadata dengan kolom genotype dan condition. Nama sampel (misalnya smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2, dll.) harus menjadi nama baris dari data frame:
Latihan ini adalah bagian dari kursus
RNA-Seq dengan Bioconductor di R
Petunjuk latihan
- Buat vektor karakter bernama
genotypeuntuk data di atas menggunakanc(). - Buat vektor karakter bernama
conditionuntuk data di atas menggunakanc(). - Buat data frame bernama
smoc2_metadatamenggunakandata.frame()dan vektor karaktergenotypesertacondition. - Buat vektor nama sampel menggunakan
c()dan tetapkan sebagai nama baris data frame menggunakanrownames().
Latihan interaktif praktis
Cobalah latihan ini dengan menyelesaikan kode contoh berikut.
# Create genotype vector
genotype <- c(___)
# Create condition vector
condition <- c(___)
# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)
# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)