Mulai sekarangMulai gratis

Hasil signifikan DESeq2

CATATAN: Memuat latihan ini mungkin memerlukan waktu sedikit lebih lama.

Sekarang mari kita ekstrak hasil yang signifikan! Asumsikan bahwa kita telah mengekstrak hasil dari latihan sebelumnya, smoc2_res.

Latihan ini merupakan bagian dari kursus

RNA-Seq dengan Bioconductor di R

Lihat Kursus

Instruksi latihan

  • Simpan hasil smoc2_res sebagai data frame dengan menggunakan fungsi data.frame() pada objek hasil tersebut.

  • Ekstrak gen yang signifikan dengan nilai p-terkoreksi kurang dari 0,05 (nilai alfa) menggunakan fungsi subset().

Latihan interaktif langsung praktik

Cobalah latihan ini dengan melengkapi kode contoh ini.

# Save results as a data frame
smoc2_res_all <- ___(___)

# Subset the results to only return the significant genes with p-adjusted values less than 0.05
smoc2_res_sig <- ___(___, ___ < ___)
Edit dan Jalankan Kode