Model DESeq2 - mengeksplorasi dispersi

CATATAN: Memuat latihan ini mungkin memerlukan sedikit waktu lebih lama.

Setelah menyesuaikan model pada latihan sebelumnya, mari kita telaah kecocokan data smoc2 kita terhadap model binomial negatif dengan memplot estimasi dispersi menggunakan fungsi plotDispEsts(). Ingat bahwa estimasi dispersi digunakan untuk memodelkan hitungan mentah; jika dispersi tidak mengikuti asumsi yang dibuat oleh DESeq2, maka ragam dalam data bisa diperkirakan kurang tepat dan hasil DE bisa menjadi kurang akurat.

Asumsi yang dibuat DESeq2 adalah bahwa dispersi umumnya menurun seiring meningkatnya rerata dan kurang lebih mengikuti garis hasil pemfitingan.