Latihan dengan vignette DESeq2

Dalam video, kita menelusuri perbedaan ekspresi gen antara sampel normal dan fibrosis dari mencit tipe liar. Pada latihan ini, kita akan menelusuri ekspresi gen antara sampel normal dan fibrosis dari mencit yang mengekspresikan berlebih gen smoc2.

Saat Anda melakukan analisis ekspresi diferensial sendiri, vignette DESeq2 adalah tempat pertama untuk mencari jawaban atas pertanyaan apa pun. Pada latihan ini, jelajahi vignette DESeq2 dan gunakan itu untuk memilih jawaban terbaik di bawah ini untuk pertanyaan:

Mengapa kita menggunakan hitungan yang tidak ternormalisasi sebagai masukan untuk DESeq2?

CATATAN: Tidak ternormalisasi berarti hitungan belum disesuaikan terhadap ukuran pustaka, yaitu jumlah total pembacaan yang dihitung per sampel.