Translations
Dans ce chapitre, nous allons exploiter des données issues de l'Open Access Series of Imaging Studies pour comparer les cerveaux de différentes populations : jeunes et âgés, hommes et femmes, sujets sains et patients atteints de maladies.
Pour commencer, centrez une coupe unique d'un volume 3D cérébral (im). Trouvez d'abord le point central dans le tableau d'image et le centre de masse du cerveau. Ensuite, translatez l'image vers le centre.
Tous les exercices de ce chapitre ont les imports suivants :
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
Cet exercice fait partie du cours
<cours>Analyse d'images biomédicales en Python</cours>Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Find image center of mass
com = ____
# Calculate amount of shift needed
d0 = 128 - _____
d1 = ____
# Translate the brain towards the center
xfm = ndi.shift(____, shift=____)