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  5. Modèles hiérarchiques et à effets mixtes en R

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Exercice

Données de toxicologie

Une toxicologue se demande si l'exposition à un produit chimique fait augmenter la mortalité à mesure que la dose augmente. Elle a exposé des organismes d'essai à différentes doses d'un produit chimique et consigné le nombre de morts dans chaque bac d'essai. Chaque dose a été répétée sur trois jours différents.

D'abord, construisez un GLM. Partir d'un modèle simple facilite le débogage. Vous comparerez aussi plus tard les résultats à ceux d'un GLMER. Ce modèle inclut dose et replicate comme effets fixes.

Ensuite, construisez un GLMER. Cette fois, dose est un effet fixe et replicate est une ordonnée à l'origine à effet aléatoire.

Enfin, examinez les estimations des coefficients avec coef() pour chaque modèle. Remarquez que les estimations de l'ordonnée à l'origine sont présentées différemment selon le modèle.

Instructions 1/3

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    3
  • Créez glm_out, un modèle glm() qui prédit mortality en fonction de dose et de replicate. Estimez une ordonnée à l'origine pour le groupe de répétition en utilisant replicate - 1.
  • Consultez les estimations des coefficients du modèle avec coef().