Données de toxicologie
Une toxicologue se demande si l'exposition à un produit chimique fait augmenter la mortalité à mesure que la dose augmente. Elle a exposé des organismes d'essai à différentes doses d'un produit chimique et consigné le nombre de morts dans chaque bac d'essai. Chaque dose a été répétée sur trois jours différents.
D'abord, construisez un GLM. Partir d'un modèle simple facilite le débogage. Vous comparerez aussi plus tard les résultats à ceux d'un GLMER. Ce modèle inclut dose et replicate comme effets fixes.
Ensuite, construisez un GLMER. Cette fois, dose est un effet fixe et replicate est une ordonnée à l'origine à effet aléatoire.
Enfin, examinez les estimations des coefficients avec coef() pour chaque modèle. Remarquez que les estimations de l'ordonnée à l'origine sont présentées différemment selon le modèle.
Cette activité fait partie du cours
Modèles hiérarchiques et à effets mixtes en R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Fit glm_out and look at its coefficient estimates
glm_out <- glm(___ ~ ___ + ___,
family = "___", data = df)
coef(___)