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Practica con la viñeta de DESeq2

En los vídeos estamos comparando la expresión génica entre las muestras normales y de fibrosis de ratones de tipo salvaje. En estos ejercicios, exploraremos la expresión génica entre las muestras normales y de fibrosis de ratones que sobreexpresan el gen smoc2.

Cuando realices tus propios análisis de expresión diferencial, la viñeta de DESeq2 será el primer lugar donde buscar respuestas. En este ejercicio, explora la viñeta de DESeq2 y úsala para elegir la mejor respuesta a la pregunta:

¿Por qué usamos recuentos no normalizados como entrada para DESeq2?

NOTA: No normalizados significa que los recuentos no se han ajustado por el tamaño de la biblioteca, que es el número total de lecturas contadas por muestra.

Este ejercicio forma parte del curso

RNA-Seq con Bioconductor en R

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Ejercicio interactivo práctico

Pon en práctica la teoría con uno de nuestros ejercicios interactivos

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