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Resumir resultados de DESeq2

NOTA: Cargar este ejercicio puede tardar un poco más.

Ahora que hemos extraído los resultados, podemos obtener un buen resumen del número de genes diferencialmente expresados para nuestro nivel alfa con la función summary(). Mostrará los números/porcentajes de genes sobreexpresados e infrarregulados, además de información sobre el filtrado independiente y los valores atípicos eliminados.

Este ejercicio forma parte del curso

RNA-Seq con Bioconductor en R

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Instrucciones del ejercicio

  • Comprueba cuántos genes están diferencialmente expresados en nuestros resultados, smoc2_res, usando la función summary() de DESeq2.

Ejercicio interactivo práctico

Prueba este ejercicio y completa el código de muestra.

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