Resumir resultados de DESeq2
NOTA: Cargar este ejercicio puede tardar un poco más.
Ahora que hemos extraído los resultados, podemos obtener un buen resumen del número de genes diferencialmente expresados para nuestro nivel alfa con la función summary(). Mostrará los números/porcentajes de genes sobreexpresados e infrarregulados, además de información sobre el filtrado independiente y los valores atípicos eliminados.
Este ejercicio forma parte del curso
RNA-Seq con Bioconductor en R
Instrucciones del ejercicio
- Comprueba cuántos genes están diferencialmente expresados en nuestros resultados,
smoc2_res, usando la funciónsummary()deDESeq2.
Ejercicio interactivo práctico
Prueba este ejercicio y completa el código de muestra.
# Get an overview of the results
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