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Asociar picos con genes

Ya casi estás listo para explorar con más detalle la relación entre picos, genes y su función. Pero antes, vamos a fijarnos en cómo se relacionan las ubicaciones de los picos con los genes. El paquete chipenrich ofrece funciones de visualización muy útiles para este fin. El objeto peaks contiene las coordenadas de los picos que usaste antes. La función plot_dist_to_tss() puede crear un gráfico de la distribución de las distancias entre las ubicaciones de los picos y el sitio de inicio de la transcripción (TSS) de los genes.

La función plot_chipenrich_spline() te permite evaluar la frecuencia de picos en relación con la longitud de los genes. Además de las frecuencias observadas, también representa la distribución esperada para la prueba exacta de Fisher, un modelo binomial y el modelo que utiliza la función chipenrich().

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Ejercicio interactivo práctico

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# Plot distribution of distances between peaks and transcription start sites
___(___, genome = "hg19")
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